Protein–RNA interactions for Protein: Q9D777

Tnfsf13, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13Q9D777 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf13Q9D777 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Tnfsf13Q9D777 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms