Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cmtm5Q9D6G9 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms