Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sec23bQ9D662 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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