Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930449I24RikQ9D5E3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms