Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ubxn11Q9D572 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn11Q9D572 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn11Q9D572 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ubxn11Q9D572 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms