Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sf3a3Q9D554 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms