Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam227bQ9D518 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms