Protein–RNA interactions for Protein: Q9D454

Uncharacterized protein CXorf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D454 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q9D454 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Q9D454 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Q9D454 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Q9D454 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Q9D454 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D454 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Q9D454 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms