Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Spns3Q9D232 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms