Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q9D1F3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms