Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Lmbr1lQ9D1E5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms