Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan11Q9D1D1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms