Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Tmem53Q9D0Z3 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms