Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lsm12Q9D0R8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms