Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY97

Ssu72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssu72Q9CY97 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssu72Q9CY97 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssu72Q9CY97 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms