Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx7Q9CY18 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Snx7Q9CY18 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms