Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Xrcc3Q9CXE6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Xrcc3Q9CXE6 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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