Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Khdc3Q9CWU5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Khdc3Q9CWU5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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