Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BccipQ9CWI3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BccipQ9CWI3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms