Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lhfpl3Q9CTN8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms