Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Q9CRC3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Q9CRC3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms