Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB9

Chchd3, MICOS complex subunit Mic19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd3Q9CRB9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chchd3Q9CRB9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd3Q9CRB9 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd3Q9CRB9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd3Q9CRB9 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chchd3Q9CRB9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Chchd3Q9CRB9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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