Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR55

UPF0547 protein C16orf87 homolog, mousemouse

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CR55 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q9CR55 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q9CR55 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Q9CR55 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Q9CR55 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q9CR55 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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