Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC12.55□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Atp6v0e1Q9CQD8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
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Atp6v0e1Q9CQD8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Atp6v0e1Q9CQD8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
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