Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms