Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Rab27bQ99P58 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rab27bQ99P58 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rab27bQ99P58 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rab27bQ99P58 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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