Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ms4a6bQ99N09 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms