Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm16973-201ENSMUST00000180682 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ms4a4dQ99N05 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ms4a4dQ99N05 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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