Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mccc1Q99MR8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mccc1Q99MR8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mccc1Q99MR8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mccc1Q99MR8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mccc1Q99MR8 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mccc1Q99MR8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mccc1Q99MR8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mccc1Q99MR8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms