Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PpifQ99KR7 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
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