Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Reep3Q99KK1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Reep3Q99KK1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms