Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ophn1Q99J31 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ophn1Q99J31 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms