Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
SptssbQ925E8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms