Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Atg13Q91YI1 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Atg13Q91YI1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Atg13Q91YI1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Atg13Q91YI1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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Atg13Q91YI1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Atg13Q91YI1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms