Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Usp3Q91W36 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Usp3Q91W36 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms