Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ppargc1bQ8VHJ7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm29151-201ENSMUST00000196669 2513 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Esp15-201ENSMUST00000178929 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms