Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBZ3

Clptm1, Cleft lip and palate transmembrane protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clptm1Q8VBZ3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clptm1Q8VBZ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Clptm1Q8VBZ3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms