Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Vmn1r200Q8R281 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r200Q8R281 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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