Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CipcQ8R0W1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms