Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc12Q8K5B8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxc12Q8K5B8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxc12Q8K5B8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc12Q8K5B8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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