Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Colec12Q8K4Q8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Colec12Q8K4Q8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms