Protein–RNA interactions for Protein: Q8K411

Pitrm1, Presequence protease, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,036 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitrm1Q8K411 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pitrm1Q8K411 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms