Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pnma3Q8JZW8 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms