Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
TwnkQ8CIW5 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TwnkQ8CIW5 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms