Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms