Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE0

Serpina11, Serpin A11, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina11Q8CIE0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serpina11Q8CIE0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serpina11Q8CIE0 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms