Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab11fip3Q8CHD8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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Rab11fip3Q8CHD8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab11fip3Q8CHD8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
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