Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Snx8Q8CFD4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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