Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl1Q8CEQ0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms