Protein–RNA interactions for Protein: Q8C963

Ccdc159, Coiled-coil domain-containing protein 159, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc159Q8C963 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc159Q8C963 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc159Q8C963 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms